- 48Dans l’intervalle
- 5Au-dessus de l’intervalle
- 1En dessous de l’intervalle
Résumé de votre clinicien
Les 54 mesures fournies ont été comparées : 48 dans l’intervalle de l’étude, 5 au-dessus et 1 en dessous. Cet exemple illustre comment un clinicien pourrait organiser les résultats pour en discuter.
Résultats à discuter
Ces exemples illustrent des résultats au-dessus et en dessous de l’intervalle ; ils ne sont pas classés par importance clinique. Un examen réel tient aussi compte des symptômes, du traitement, des données probantes et de l’incertitude. Un résultat hors intervalle n’appelle pas automatiquement une hausse ou une baisse.
Oscillibacter sp. KLE 1745
Au-dessus de l’intervalleCe que cela signifie
Ce type particulier d’Oscillibacter représentait une part de l’échantillon plus grande que chez la plupart du groupe de comparaison.
Hungatella hathewayi
Au-dessus de l’intervalleCe que cela signifie
Une part plus grande que chez la plupart du groupe de comparaison. Cette espèce apparaît dans des recherches sur l’alimentation et l’intestin menées dans d’autres groupes de personnes.
Akkermansia glycaniphila
Au-dessus de l’intervalleCe que cela signifie
Détectée à une très petite part, là où la plupart du groupe de comparaison n’en avait aucune détectée.
Butyricicoccus sp. K4410.MGS-46
Au-dessus de l’intervalleCe que cela signifie
Légèrement au-dessus de l’intervalle, près de sa limite supérieure.
Faecalibacterium prausnitzii
En dessous de l’intervalleCe que cela signifie
Une part plus petite que chez la plupart du groupe de comparaison. C’est une bactérie intestinale très étudiée, souvent évoquée avec le butyrate et le système immunitaire.
Roseburia intestinalis
Au-dessus de l’intervalleCe que cela signifie
Une part plus grande que chez la plupart du groupe de comparaison. Cette espèce est étudiée pour sa production de butyrate, un acide gras à chaîne courte.
Prochaines étapes
Nous parlerons de ces six comparaisons lors de votre rendez-vous, et nous déciderons ensemble si l’une d’elles mérite un examen plus attentif.
Suivi
Un échantillon ultérieur pourrait être comparé à celui-ci pour voir ce qui a changé, sans présumer pourquoi.
Les 54 mesures
Toutes les mesures fournies, regroupées par type. Chaque pourcentage conserve son dénominateur d’origine ; les pourcentages des bactéries et des voies ne doivent pas être additionnés. Les valeurs affichées sont arrondies.
Types de bactéries 47
| Mesure | Mesuré | Intervalle de référence | Comparaison |
|---|---|---|---|
| Atopobium sp. BV3Ac4 | 0% | 0% – 0.00024% | Dans l’intervalle |
| Coriobacteriaceae bacterium BV3Ac1 | 0.000208% | 0% – 0.000994% | Dans l’intervalle |
| Fusicatenibacter saccharivorans | 0.393% | 0.181% – 1.38% | Dans l’intervalle |
| Oscillibacter sp. KLE 1745 | 1.21% | 0.071% – 0.671% | Au-dessus de l’intervalle |
| Blautia sp. KLE 1732 | 0.505% | 0.152% – 1.41% | Dans l’intervalle |
| Clostridium sp. KLE 1755 | 0.00735% | 0.00708% – 0.0999% | Dans l’intervalle Comparaison moins certaine |
| Ruminococcus sp. CAG:330 | 0% | 0% – 0.0182% | Dans l’intervalle |
| Firmicutes bacterium CAG:791 | 0.00221% | 0.00042% – 0.00355% | Dans l’intervalle |
| Firmicutes bacterium CAG:41 | 0.174% | 0.0152% – 0.35% | Dans l’intervalle |
| Butyrivibrio sp. AD3002 | 0.0022% | 0.000431% – 0.00466% | Dans l’intervalle |
| Intestinimonas butyriciproducens | 0.02% | 0.0121% – 0.107% | Dans l’intervalle |
| Atopobium minutum | 0.001% | 0% – 0.00194% | Dans l’intervalle |
| Lachnospiraceae bacterium AC2012 | 0.00255% | 0.00041% – 0.0027% | Dans l’intervalle Comparaison moins certaine |
| Eisenbergiella tayi | 0.0113% | 0.00189% – 0.0804% | Dans l’intervalle |
| Hungatella hathewayi | 0.478% | 0.023% – 0.123% | Au-dessus de l’intervalle |
| Ruthenibacterium lactatiformans | 0.135% | 0.0503% – 0.605% | Dans l’intervalle |
| Corynebacterium imitans | 0% | 0% – 0.000848% | Dans l’intervalle |
| Akkermansia glycaniphila | 0.003% | 0% – 0.000724% | Au-dessus de l’intervalle |
| Actinomyces sp. HMSC065F11 | 0% | 0% – 0.000848% | Dans l’intervalle Comparaison moins certaine |
| Butyricicoccus sp. K4410.MGS-46 | 0.187% | 0.0161% – 0.159% | Au-dessus de l’intervalle |
| Ndongobacter massiliensis | 0% | 0% – 0.00121% | Dans l’intervalle |
| Mobiluncus curtisii | 0.00177% | 0.000496% – 0.00362% | Dans l’intervalle |
| Catabacter hongkongensis | 0.00146% | 0.000268% – 0.00495% | Dans l’intervalle |
| Peptococcus niger | 0% | 0% – 0.00199% | Dans l’intervalle |
| Peptoniphilus indolicus | 0% | 0% – 0.000835% | Dans l’intervalle |
| [Ruminococcus] torques | 0.0471% | 0.0151% – 0.497% | Dans l’intervalle |
| [Clostridium] asparagiforme | 0.0495% | 0.00733% – 0.0591% | Dans l’intervalle |
| Eubacterium ramulus | 0.26% | 0.0593% – 0.45% | Dans l’intervalle |
| Coprococcus comes | 0.133% | 0.0882% – 0.577% | Dans l’intervalle |
| Rothia mucilaginosa | 0.00172% | 0.0000755% – 0.00434% | Dans l’intervalle |
| Corynebacterium urealyticum | 0% | 0% – 0.00104% | Dans l’intervalle |
| Corynebacterium massiliense | 0% | 0% – 0.000735% | Dans l’intervalle |
| Brevibacterium ravenspurgense | 0% | 0% – 0.000487% | Dans l’intervalle |
| Olsenella umbonata | 0% | 0% – 0.0000184% | Dans l’intervalle Comparaison moins certaine |
| Leptotrichia sp. oral taxon 212 | 0% | 0% – 0.0000834% | Dans l’intervalle Comparaison moins certaine |
| Haemophilus parainfluenzae | 0.000611% | 0.0001% – 0.0575% | Dans l’intervalle |
| Aggregatibacter aphrophilus | 0% | 0% – 0.000438% | Dans l’intervalle |
| Gemella sanguinis | 0% | 0% – 0.00147% | Dans l’intervalle |
| Dorea longicatena | 0.285% | 0.0855% – 1.07% | Dans l’intervalle |
| Mageeibacillus indolicus | 0.000529% | 0% – 0.00137% | Dans l’intervalle |
| Faecalibacterium prausnitzii | 0.0816% | 0.163% – 1.64% | En dessous de l’intervalle |
| Roseburia intestinalis | 2.79% | 0.123% – 2.32% | Au-dessus de l’intervalle |
| Roseburia inulinivorans | 0.945% | 0.165% – 1.72% | Dans l’intervalle |
| Roseburia hominis | 0.499% | 0.0985% – 0.9% | Dans l’intervalle |
| Akkermansia muciniphila | 0.59% | 0.000993% – 1.18% | Dans l’intervalle |
| Bifidobacterium longum | 0.429% | 0.00095% – 0.857% | Dans l’intervalle |
| Bifidobacterium adolescentis | 0.561% | 0.000242% – 1.12% | Dans l’intervalle |
Processus génétiques 7
| Mesure | Mesuré | Intervalle de référence | Comparaison |
|---|---|---|---|
| GLUCUROCAT-PWY: superpathway of β-D-glucuronide and D-glucuronate degradation | 0.0106% | 0.0039% – 0.0132% | Dans l’intervalle |
| PWY-5177: glutaryl-CoA degradation | 0.00474% | 0.00156% – 0.00792% | Dans l’intervalle |
| GLUDEG-I-PWY: GABA shunt | 0.00218% | 0% – 0.00436% | Dans l’intervalle |
| TRPSYN-PWY: L-tryptophan biosynthesis | 0.00991% | 0.00329% – 0.0165% | Dans l’intervalle |
| PWY-5676: acetyl-CoA fermentation to butanoate II | 0.00189% | 0% – 0.00378% | Dans l’intervalle |
| PWY-5022: 4-aminobutanoate degradation V | 0.0012% | 0% – 0.0024% | Dans l’intervalle |
| PWY-5100: pyruvate fermentation to acetate and lactate II | 0.00977% | 0.00428% – 0.0153% | Dans l’intervalle |
Méthodes, en bref
- Un laboratoire séquence l’échantillon. Le prototype lit le tableau de mesures traité ; il ne séquence pas lui-même les échantillons.
- Chaque mesure est comparée au 10e et au 90e centile d’un groupe de comparaison issu d’une étude, modélisés pour l’âge, le sexe et l’IMC enregistrés.
- Une seule version figée du modèle est utilisée, pour qu’un rapport ultérieur puisse être comparé à la même référence.
- Les comparaisons décrivent où se situe un résultat par rapport à un groupe d’étude. La validation clinique est la prochaine étape de la recherche.
- L’exemple SEP utilise 460 témoins du même foyer de la cohorte publique iMSMS, dans le jeu de développement. Les cas de SEP et le jeu de test interne verrouillé n’ont pas servi à ajuster ces intervalles.
- Le modèle estime les 10e–90e percentiles en tenant compte de l’âge, du sexe enregistré et de l’IMC. Cet intervalle central de 80 % est une comparaison d’étude, pas une cible saine cliniquement établie.